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《生物信息学技术在水稻功能基因研究中的应用》可供从事分子生物学研究的本科生、研究生和科研工作者参考使用。
内容简介
本书概述了水稻种子中蛋白质的种类和特性,重点介绍了谷蛋白结构、组成及其基因特点。阐述了利用生物信息学技术克隆分析水稻功能基因,具有投入少、速度快、技术要求低和针对性强等优点。设计了两个运用生物信息学技术克隆水稻谷蛋白基因的实验,并最终成功获得了3个较有价值的谷蛋白新基因。本书可供从事分子生物学研究的本科生、研究生和科研工作者参考使用。
目录
第1章 水稻谷蛋白研究进展
1.1 水稻贮藏蛋白
1.2 水稻谷蛋白的生物合成
1.3 水稻谷蛋白基因的克隆及其结构与表达分析
1.4 谷蛋白与水稻育种
1.4.1 水稻谷蛋白突变体的形成途径
1.4.2 水稻低谷蛋白突变体LGC-1
第2章 水稻功能基因的电子克隆
2.1 水稻功能基因电子克隆的方法
2.1.1 利用EST数据库信息
2.1.2 利用基因组信息
2.2 与水稻功能基因电子克隆相关的生物信息资源
2.3 电子克隆中的一些常见问题和对策
2.4 水稻电子克隆技术的展望
第3章 水稻谷蛋白基因GluB-4的克隆与表达分析
3.1 材料与方法
3.1.1 试验材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果与分析
3.2.1 全长GluB-4的克隆与序列分析
3.2.2 GluB-4 mRNA的组织特异性表达
3.2.3 GluB-4 mRNA的时间特异性表达
3.2.4 Southern杂交分析
3.3 讨论
第4章 LGC-1氐谷蛋白突变相关基因的GluB-5克隆与序列分析
4.1 材料与方法
4.1.1 试验材料
4.1.2 试验方法
4.2 结果与分析
4.2.1 已知谷蛋白基因在LGC-1和NM中表达无差异
4.2.2 利用生物信息学技术克隆到1个新谷蛋白基因GluB-5
4.2.3 新谷蛋白基因GluB-5在LGC-1中表达被抑制
4.2.4 新谷蛋白基因GluB-5RNA在LGC-1中发生了编辑
4.2.5 GluB-5在水稻基因组中数多拷贝基因
4.3 讨论
参考文献
缩略语
精彩书摘
第1章 水稻谷蛋白研究进展
水稻是世界上最重要的农作物之一,全世界有40%的人口以大米为主食。水稻种子蛋白质含量占粒重的7%~10%,主要以贮藏蛋白的形式存在于胚乳中。因此,大米是人们(尤其是亚洲人)蛋白质消费的重要来源。谷蛋白是水稻种子主要贮藏蛋白,也是稻米中能被人体消化的主要蛋白成分。随着经济的发展和生活水平的提高,人们对大米的蛋白品质也提出了更高的要求。因而,改善谷蛋白含量,培育适合不同消费群体的新品种,一直是水稻育种的一个重要目标。
1.1 水稻贮藏蛋白
水稻种子蛋白质主要以贮藏蛋白的形式存在于胚乳。水稻贮藏蛋白按溶解性可分为清蛋白(溶于水)、球蛋白(溶于稀盐)、谷蛋白(溶于稀酸、稀碱)和醇溶蛋白(溶于60%K,醇)。其中谷蛋白占米粒总蛋白的60%~80%,醇溶蛋白占5%~10%(Cagampang,1966;Padhye,1979;Resurreccion,1983)。实验早已证实,种子贮藏蛋白存积于蛋白体(protein body,PB)中。对玉米、大麦、小麦等大部分禾谷类种子胚乳中单一蛋白体的分离与特性分析表明,存积于其中的蛋白质主要是醇溶蛋白。于是,长期以来,醇溶蛋白被认为是禾谷类的主要贮藏蛋白(Burr,1976;Camero,1980;Pemollet,1983)。然而,后来的实验还证实,水稻胚乳中却存在两种蛋白体,PB—Ⅰ与PB.Ⅱ,它们主要由醇溶蛋白和谷蛋白组成,这与其他禾谷类种子有着显著区别。
前言/序言
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