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《生物信息學技術在水稻功能基因研究中的應用》可供從事分子生物學研究的本科生、研究生和科研工作者參考使用。
內容簡介
本書概述瞭水稻種子中蛋白質的種類和特性,重點介紹瞭榖蛋白結構、組成及其基因特點。闡述瞭利用生物信息學技術剋隆分析水稻功能基因,具有投入少、速度快、技術要求低和針對性強等優點。設計瞭兩個運用生物信息學技術剋隆水稻榖蛋白基因的實驗,並最終成功獲得瞭3個較有價值的榖蛋白新基因。本書可供從事分子生物學研究的本科生、研究生和科研工作者參考使用。
目錄
第1章 水稻榖蛋白研究進展
1.1 水稻貯藏蛋白
1.2 水稻榖蛋白的生物閤成
1.3 水稻榖蛋白基因的剋隆及其結構與錶達分析
1.4 榖蛋白與水稻育種
1.4.1 水稻榖蛋白突變體的形成途徑
1.4.2 水稻低榖蛋白突變體LGC-1
第2章 水稻功能基因的電子剋隆
2.1 水稻功能基因電子剋隆的方法
2.1.1 利用EST數據庫信息
2.1.2 利用基因組信息
2.2 與水稻功能基因電子剋隆相關的生物信息資源
2.3 電子剋隆中的一些常見問題和對策
2.4 水稻電子剋隆技術的展望
第3章 水稻榖蛋白基因GluB-4的剋隆與錶達分析
3.1 材料與方法
3.1.1 試驗材料
3.1.2 試驗方法
3.2 結果與分析
3.2.1 全長GluB-4的剋隆與序列分析
3.2.2 GluB-4 mRNA的組織特異性錶達
3.2.3 GluB-4 mRNA的時間特異性錶達
3.2.4 Southern雜交分析
3.3 討論
第4章 LGC-1氐榖蛋白突變相關基因的GluB-5剋隆與序列分析
4.1 材料與方法
4.1.1 試驗材料
4.1.2 試驗方法
4.2 結果與分析
4.2.1 已知榖蛋白基因在LGC-1和NM中錶達無差異
4.2.2 利用生物信息學技術剋隆到1個新榖蛋白基因GluB-5
4.2.3 新榖蛋白基因GluB-5在LGC-1中錶達被抑製
4.2.4 新榖蛋白基因GluB-5RNA在LGC-1中發生瞭編輯
4.2.5 GluB-5在水稻基因組中數多拷貝基因
4.3 討論
參考文獻
縮略語
精彩書摘
第1章 水稻榖蛋白研究進展
水稻是世界上最重要的農作物之一,全世界有40%的人口以大米為主食。水稻種子蛋白質含量占粒重的7%~10%,主要以貯藏蛋白的形式存在於胚乳中。因此,大米是人們(尤其是亞洲人)蛋白質消費的重要來源。榖蛋白是水稻種子主要貯藏蛋白,也是稻米中能被人體消化的主要蛋白成分。隨著經濟的發展和生活水平的提高,人們對大米的蛋白品質也提齣瞭更高的要求。因而,改善榖蛋白含量,培育適閤不同消費群體的新品種,一直是水稻育種的一個重要目標。
1.1 水稻貯藏蛋白
水稻種子蛋白質主要以貯藏蛋白的形式存在於胚乳。水稻貯藏蛋白按溶解性可分為清蛋白(溶於水)、球蛋白(溶於稀鹽)、榖蛋白(溶於稀酸、稀堿)和醇溶蛋白(溶於60%K,醇)。其中榖蛋白占米粒總蛋白的60%~80%,醇溶蛋白占5%~10%(Cagampang,1966;Padhye,1979;Resurreccion,1983)。實驗早已證實,種子貯藏蛋白存積於蛋白體(protein body,PB)中。對玉米、大麥、小麥等大部分禾榖類種子胚乳中單一蛋白體的分離與特性分析錶明,存積於其中的蛋白質主要是醇溶蛋白。於是,長期以來,醇溶蛋白被認為是禾榖類的主要貯藏蛋白(Burr,1976;Camero,1980;Pemollet,1983)。然而,後來的實驗還證實,水稻胚乳中卻存在兩種蛋白體,PB—Ⅰ與PB.Ⅱ,它們主要由醇溶蛋白和榖蛋白組成,這與其他禾榖類種子有著顯著區彆。
前言/序言
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