内容简介
《生命科学名著:微生物基因组》是由微生物基因组学开创者们撰写,重点介绍了10年来微生物学转向全基因组序列研究的进展,包括微生物基因组学的历史、作为基因组学工具的生物信息学、核心功能、微生物基因组的进化、微生物基因组的调查和基因组数据库的应用共6个部分。所有内容均涉及本学科前沿,作者们现身说法,深入浅出,既能使初涉微生物基因组学领域的研究生们感兴趣,又能使在微生物学和基因组学方面有造诣的专家们参考,是微生物学专著中的精品。
《生命科学名著:微生物基因组》可供从事微生物学、基因组学、病理学、生态学、酶学、蛋白质组学、植物病理学等领域的研究生、教师和研究人员阅读。
内页插图
目录
译者的话
序
前言
编著者
第一部分:引言
1 微生物基因组学的历史
第二部分:作为基因组学工具的生物信息学
2 寻找基因和全基因组比较的工具
3 TIGR的细菌基因组注释
4 生物信息学与微生物致病作用
5 噬菌体生物信息学
第三部分:核心功能
6 微生物代谢比较
7 膜转运蛋白的基因组学分析
8 用基因组学分析细菌细胞周期
第四部分:微生物基因组的进化
9 原核生物的进化及分类简史
10 细菌基因组如何变化
11 基因组学时代的细菌生物多样性概念
12 病原菌和共生菌与寄主的协同进化
第五部分:微生物基因组的调查
13 植物病原菌基因组调查
14 不产氧光合细菌
15 嗜热微生物基因组
16 病原肠细菌基因组
17 专性细胞内病原体
18 低G+C含量革兰氏阳性细菌基因组
19 放线菌(G+,高G+C含量)基因组学
20 寄生虫基因组学
21 极端嗜盐古生菌基因组分析
第六部分:基因组数据库的应用
22 微阵列表达分析和细菌基因组
23 微生物种群基因组学与生态学
24 基因组学在生物催化和生物降解中的应用
25 酶的发现与微生物基因组学
26 基因组学在药物发现过程中的整合
27 基因组法开发疫苗
28 微生物蛋白质组学
索引
前言/序言
在过去10年中,微生物学领域已转向全基因组序列研究,其中,位于马里兰州Rockville的基因组研究所(TIGR)在这一领域起了很大的作用,该所的科学家们公布了最早测得的三种微生物全基因组序列——流感嗜血菌、生殖道支原体和詹氏甲烷球菌。截至2004年1月,在已完成测序并公布的150多个基因组序列中,他们所公布的基因组序列有40多个。因此,借着这个令人鼓舞的机会,Humana出版公司计划出一本关于该领域研究进展的书,各章作者中很多是我们基因组研究所的同事,也有来自世界各地的一些专家。
微生物基因组学是一个非常大的领域,当选择每一章的题目时,我们意识到,要么涵盖较大范围而对相关知识仅作初步介绍,要么把我们认为非常重要的一些问题深入讨论,我们选择了前者。我们希望《微生物基因组》-书能描述更广的内容,能使初涉这一领域的读者和具有专业知识的人都对此书感兴趣。作为主编,我们发现一些很有趣的事情,尽管题目各不相同,某些重复出现的主题却贯穿全书,如基因水平转移、比较基因组分析的重要性和基于微阵列的基因表达分析。
《微生物基因组》分为6个主要部分,为让读者更好地了解这一领域的发展,分出一部分介绍微生物基因组学历史是十分必要的,所以主编委托Hamilton Smith准备这一介绍性文章。“作为基因组学工具的生物信息学”部分,提供了用于基因组学及其应用的最常用的计算工具。“核心功能”部分介绍了每个微生物基因组都包括的微生物代谢、运输和细胞循环等过程。“微生物基因组的进化”中,安排了一系列章节,目的是告诉大家,基因组学如何重建微生物世界的历史和动态性。在“微生物基因组的调查”中,组织了一系列章节并有选择性地论述了一些生物类群。尽管没有涵盖每种微生物基因组(而另一些种在多个章节中被描述),但我们的目的是提供一些从基因组研究可以获得的生物信息。最后是“基因组数据库的应用”,这部分描述如何用基因组序列研究微生物中最重要的问题。值得一提的是,在本书撰写期间,即2002年底到2003年初,许多尚未完成的基因组测序现已完成,感兴趣的读者可以访问像基因组研究所数据库这样的网站,以便得到最新的信息。
如果没有TrinaEacho女士的帮助,这本书不可能成功出版,她利用很多周末时间组织各个章节并形成初稿,主编们对她的诸多贡献非常感激。
当然,此书难免有疏漏之处,而且它也不能涵盖所有的重要方面,我们希望著者们的集思广益及各章节的内容能给诸位读者以启发。微生物基因组学包括了进化与种群生物学、基因表达分析、蛋白质组学以及很多与DNA序列相关的研究。毫不夸张地说,微生物基因组学跨越了微生物学科本身的广度和深度。
生命科学名著:微生物基因组 [Microbial Genomes] epub pdf mobi txt 电子书 下载 2024
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