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内容简介

　　《数量性状遗传分析》的主要内容由两部分组成。一部分是基于经典遗传学的数量遗传学。首先，在多基因遗传体系假说下，讲述了数量性状多基因间的有关加性、显性和上位效应内含的遗传统计学模型；定义了基因在群体中的平均效应和个体的育种值，探讨了基因型值和育种值间的关系；讲述了品系间杂交有关近交群体的伯明翰学派的遗传分析特点，阐明了远交群体的北美学派的遗传分析方法；论述了遗传力、重复力和相关的定义、估计方法和假设检验；讲述了单性状选择及综合选择指数的有关概念、分析和发展；论述了作者提出的组合性状和组合性状对的遗传分析和应用；讲解了交配效应和配合力分析。在主基因-多基因遗传体系之下，简介了它的分离分析的理论和方法，并探讨它的综合选择指数的分析方法。第二部分是在数量性状的分子遗传学研究上，简述了QTL定位、分子标记辅助选择和基因组功能分析。在有关多性状选择基因组功能分析中，利用通径分析及其决策分析给出了各因子的直接作用、间接作用和总作用，并对各因子在选择和功能上的主次作用进行了判断。
　　《数量性状遗传分析》适合遗传育种工作者、应用数学工作者，以及有关专业的研究生教师作为参考书或教材。

内页插图

目录

前言

第1章 数量性状遗传研究基础
1．1 遗传学基础及其发展
1．1．1 质量性状遗传与经典遗传学的发展
1．1．2 数量性状遗传与数量遗传学的发展
1．1．3 DNA标记与现代数量遗传学
1．1．4 数量遗传学在我国的发展
1．2 群体遗传学基础及其发展
1．2．1 孟德尔群体遗传结构的数学模型
1．2．2 随机交配下理想大孟德尔群体的平衡
1．2．3 群体在非随机交配下的遗传效应
1．2．4 改变群体基因频率的因素
1．3 统计学基础
1．3．1．正态分布及其参数估计
1．3．2 有限混合正态分布及其参数估计
1．3．3 线性统计模型基础

第2章 近交与随机交配群体的遗传分析
2．1．基因型与环境
2．1．1 表现型值与基因型值
2．1．2 基因型与环境互作的方差分析
2．2 基因型值分解、基因的平均效应和育种值
2．2．1 基因型值的分解
2．2．2 平衡群体中基因的效应
2．2．3 平衡群体中个体的育种值和育种效应
2．2．4 育种值和基因型值的关系
2．3 近交群体数量性状的世代均数分析
2．3．1 世代平均数的遗传组成(期望组分)
2．3．2 遗传参数估计与遗传模型检验
2．4 近交群体数量性状的世代方差分析
2．4．1 不分离世代的方差
2．4．2 分离世代集团混种(混养)的方差剖分
2．4．3 F1 代连续自交的分支交配系统方差的逐级分解
2．4．4 S3、S4世代方差的分解
2．4．5 显性度
2．4．6 自交选择的*适世代及分离极限估计
2．5 连锁对世代均数和方差的影响
2．5．1 加性-显性遗传模型下的两对与多对基因连锁的F2 代遗传分析
2．5．2 连锁对F1 代连续自交的分支交配系统方差的影响
2．5．3 连锁不平衡群体
2．6 随机交配群体中亲属间的相关与回归
2．6．1 随机交配平衡群体中亲属遗传协方差及其相似性
2．6．2 近亲交配群体的近交系数计算
2．6．3 亲属协方差的一般形式
2．6．4 常见亲属协方差组分中U和r的计算

第3章 重复力、遗传力、相关及其估计
3．1 重复力、遗传力和相关的概念
3．1．1 遗传力(率)和重复力(率)
3．1．2 表型相关、遗传相关和环境相关
3．1．．3 亲属问的表型相似性
3．2 重复力、广义遗传力估计及重复力的应用
3．2．1 单因素遗传设计试验的组内相关估计方法
3．2．2 重复力的准确度及其应用
3．3 狭义遗传力的估计
3．3．1 用双亲本杂交类型遗传设计估计遗传力
3．3．2 用NCI遗传设计试验估计狭义遗传力
3．3．3 用NCII遗传设计试验估计狭义遗传力
3．3．4 用NCIII遗传设计估计狭义遗传力
3．4 多个数量性状的遗传力和相关估计
3．4．1 单因素遗传设计完全随机区组试验估计方法
3．4．2 NCI遗传设计完全随机试验的多性状遗传力和相关估计
3．5 阈性状及其重复力、遗传力的估计
3．5．1 阈性状的重复力估计
3．5．2 阈性状的遗传力估计
3．6 遗传力、重复力显著性测验原理
3．6．1．均方的方差估计
3．6．2 均方比的方差估计
3．6．3 常用遗传设计试验中组内相关系数的假设检验

第4章 选择原理、方法和模型
4．1．选择的基本原理
4．1．1 选择及其预期选择反应
4．1．2 选择极限与世代选择效率指数
4．1．3 世代间隔、单位时间遗传进展与现实遗传力
4．2 单性状选择方法
4．2．1 个体选择
4．2．2 家系选择与同胞选择
4．2．3 家系内选择
4．2．4 合并选择
4．2．5 几种选择方法相对效率比较
4．3 间接选择和综合选择指数
4．3．1 间接选择
4．3．2 多性状的选择．综合选择指数
4．3．3 选择指数的通径分析和决策分析
4．3．4 相关遗传进展分解原理与决定系数遗传力
4．4 通用选择指数
4．4．1 通用选择指数
4．4．2 通用选择指数的通径分析和决策分析
4．5 组合性状与组合性状对分析
4．5．1 约束组合性状分析
4．5．2 约束组合性状对分析及其通径分析、决策分析

第5章 主基因．多基因遗传体系分析
5．1 单个分离世代数量性状的分离分析
5．1．1 单个分离世代表型分布的主要特征
5．1．2 F2 代数量性状分离分析模型
5．1．3 回交世代的主基因．多基因混合遗传分离分析模型
5．1．4 单个分离世代数量性状分离分析的一步法和两步法
5．2 数量性状的多世代联合分离分析简介
5．3 主基因．多基因数量性状的综合选择指数
5．3．1 综合选择指数原理
5．3．2 应用举例

第6章 交配效应与配合力分析
6．1 交配效应分析
6．1．1 近交衰退
6．1．2 近交导致的群体遗传方差再分配
6．1．3 杂种优势
6．1．4 杂交引起的群体遗传方差再分配
6．1．5 近交、杂交与环境方差
6．1．6 杂种优势的机理
6．2 配合力分析
6．2．1 配合力概念及其方差
6．2．2 配合力估计的试验设计方法
6．2．3 双列杂交完全随机区组试验的配合力分析
6．2．4 关于多元双列杂交的配合力分析

第7章 数量性状与分子遗传学
7．1．数量性状与遗传学
7．1．1 数量性状与经典遗传学
7．1．2 数量性状与分子遗传学
7．1．3 遗传标记与基因定位
7．2 QTL的初级定位及其作图原理
7．2．1 作图群体的建立
7．2．2 图谱构建的理论基础
7．3 单标记分析法
7．3．1 单标计分析样本资料表
7．3．2 用重组率，表示的标记和QTL基因型频率表
7．3．3 基于标记分组的标记和QTL的共分离信息
7．3．4 均值差．方差分析法及参数估计
7．3．5 最大似然估计的EM算法
7．4 区间作图法和复合区间作图法
7．4．1 区间作图法
7．4．2 复合区间作图法
7．5 数量性状的标记辅助选择
7．5．1 标记值选择
7．5．2 指数选择
7．5．3 数量性状的分子标记辅助选择
7．6 KEGG通路的通径分析及其决策分析
7．6．1 DIA方法的KEGG通路
7．6．2 KEGG通路DIA影响的通径分析及其决策分析
7．6．3 细胞过程路梯度分析、通径分析及其决策分析
7．6．4 梯度分析、通径分析及其决策分析与DIA方法的比较
参考文献

前言/序言

　　数量遗传学是研究数量性状遗传规律并服务于动植物育种的一门学科。对数量性状进行遗传操纵的理论和方法既是数量遗传学的中心内容，也是数量遗传学应用于育种实践的桥梁和手段。因而，任一遗传学分支服务于育种的研究均可纳入数量遗传学的理论体系，可见数量性状遗传分析内涵的丰富和发展潜力。
　　接触和学习数量遗传学是源于我的一个朴素的想法：农学院的数学从主流上应走与农业科学相结合的道路。因而，除自学遗传学等基础生物学之外，吴仲贤教授的《统计遗传学》和马育华教授的《植物育种的数量遗传学基础》几十年来始终伴随着我，其浓厚的育种机理和透彻的数理分析使我如临教诲。“文化大革命”后重招研究生起，我为研究生讲授“生物数学”、“试验设计与分析”、“数量遗传学”和“群体遗传学”课程，并协助赵洪章院士和邱怀教授指导研究生，使我受益匪浅。1992年，我被评为国家动物遗传育种与繁殖博士生导师，开始了以数量遗传学和群体遗传学为主要选题的研究生培养工作。1981-2014年，我和我的研究生发表了40余篇数量性状遗传分析的论文，提出了通径分析的决策分析、组合性状和组合性状对遗传分析、小麦生态型及其演变的统计分析方法和KEGG通路的通径分析等，结合数量遗传学的发展，写成了本书。全书共7章，前3章叙述数量遗传学的研究基础，近交群体和随机交配群体的遗传分析，重复力和遗传力等相关概念、估计和检验；第4章讲述单性状选择、多性状选择和组合性状与组合性状对分析；第5章介绍主基因。多基因混合遗传体系下的单分离世代和多世代联合的分离分析及综合选择指数；第6章叙述交配效应与配合力分析；第7章讲述数量性状遗传与分子遗传学，主要内容包括QTL定位、DNA标记辅助选择的标记值选择和指数选择、KEGG通路的通径分析和决策分析。
　　本书编写由袁志发和常智杰负责，并在杜俊莉博士、解小莉博士、刘建军副教授、曲高平硕士和马訾伟硕士的协助下完成。
　　在几十年的学习和研究中，周静芋教授是我最尊重的合作者。常智杰教授、郭满才教授、孙世铎教授、翟永功教授、贾青教授、雷雪芹教授、徐廷生教授、陈玉林教授、张恩平教授、秦豪荣教授、吉俊玲教授、王春平教授、郑惠玲副教授、宋世德副教授、解小莉副教授、刘璐副教授、刘建军副教授、杜俊莉博士、邵建成、王丽波、董晓萌、陈小蕾、曲高平、罗风娟、马訾伟等，我们既是师生，又是良友。本书是我们共同学习、研究和写作的成果。
　　我于1962年毕业于兰州大学数学力学系，对于遗传学领域是后学，本书如有不足之处，恳请读者批评指正，以便日后修改。
　　感谢中国科学院出版基金对本书的支持。
　　袁志发
　　2014年6月于西北农林科技大学

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