新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版)

新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版) pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

[美] 吳,C.Chen 著
圖書標籤:
  • 蛋白質組學
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齣版社: 科學齣版社
ISBN:9787030369901
版次:01
商品編碼:11213680
包裝:平裝
叢書名: 新生物學叢書
開本:16開
齣版時間:2013-03-01
用紙:膠版紙
頁數:404
正文語種:英文

具體描述

內容簡介

  隨著蛋白質組學技術自身及其在生命科學與醫學應用中的快速發展,許多生物信息學方法、數據庫和軟件被開發齣來並成功用於比較蛋白質組學研究。在《新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版)》中,專傢描述瞭相關領域中最新的現狀、挑戰、所麵臨的開放性問題、以及未來的發展趨勢。《新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版)》內容涉及發展比較蛋白質組學研究所需的生物信息學工具和資源,為瞭解該領域提供瞭具有相當廣度和深度的知識體係和引用參考。這些對於在實驗中獲得理想的結果至關重要。《新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版)》內容全麵、易於使用,對所有希望瞭解蛋白質組學數據分析和係統生物學層麵上比較蛋白質組學的生物信息學數據庫、工具、新計算方法及其未來發展趨勢的讀者都有所裨益。

目錄

Preface

Contributors

PART I: BIOINFORMATICS FRAMEWORK FOR COMPARATIVE PROTEOMICS

1 Protein Bioinformatics Databases and Resources

Churning Chen, Hongzhan Huang, and Cathy H. Wu

2 A Guide to UniProt for Protein Scientists

Claire O'Donovan and Rolf Apweiler

3 InterPro Protein Classification

Jennifer McDowall and Sarah Hunter

4 Reactome Knowledgebase of Human Biological

Pathways and Processes

Peter D'Eustachio

5 eFIP: A Tool for Mining Functional Impact

of Phosphorylation from Literature

Cecilia N. Arighi, Amy Y. Siu, Catalina O. Tudor,

Jules A. Nchoutrnboube, Cathy It. Wu, and Vijay K. Shanker

6 A Tutorial on Protein Ontology Resources for Proteomic Studies

Cecilia N. Arighi

7 Structure-Guided Rule-Based Annotation. of Protein

Functional Sites in UniProt Knowledgebase

Sona Vasudevan, C.R. Vinayaka, Darren A. Natale,

Hongzhan Huang, Robel Y. Kahsay, and Cathy H. Wu

PART II: PROTEOMIC BIOINFORMATICS

8 Modeling Mass Spectrometry-Based Protein Analysis

Jan Eriksson and David Feny

9 Protein Identification from Tandem Mass Spectra

by Database Searching

Nathan J. Edwards

10 LC-MS Data Analysis for Differential

Protein Expression Detection

Rency S. Varghese and Habtorn W. Ressom

11 Protein Identification by Spectral Networks Analysis

Nuno Bandeira

12 Software Pipeline and Data Analysis for MS/MS Proteomics:

The Trans-Proteomic Pipeline

Andrew Keller and David Shteynberg

13 Analysis of High-Throughput ELISA Microarray Data

Amanda M. White, Don S. Daly, and Richard C. Zangar

14 Proteomics Databases and Repositories

Lennart Martens

15 Preparing Molecular Interaction Data for Publication

Sandra Orchard and Henning Hermjakob

16 Submitting Proteomics Data to PRIDE Using PRIDE Converter

Harald Barsnes, Juan Antonio Vizcalno, Florian Reisinger,

Ingvar Eidhammer, and Lennart Martens

17 Automated Data Integration and Determination of

Posttranslational Modifications with the Protein Inference Engine

Stuart R. Jefferys and Morgan C. Giddings

18 An Integrated Top-Down and Bottom-Up Strategy

for Characterization of Protein Isoforms and Modifications

Si Wu, Nikola Toli, Zhixin Tian, Errol W. Robinson,

and Ljiljana Paa- Toli

PART III: COMPARATIVE PROTEOMICS IN SYSTEMS BIOLOGY

19 Phosphoproteome Resource for Systems Biology Research

Bernd Bodenmiller and Ruedi Aebersold

20 Protein-Centric Data Integration for Functional Analysis of

Comparative Proteomics Data

Peter B. McGarvey, Jian Zhang, Darren A. Natale,

Cathy H. Wu, and Hongzhan Huang

21 Integration of Proteomic and Metabolomic Profiling

as well as Metabolic Modeling for the Functional

Analysis of Metabolic Networks

Patrick May, Nils Christian, Oliver Ebenhh,

Wolfram Weckwerth, and Dirk Walther

22 Time Series Proteome Profiling

Catherine A. Formolo, Michelle Mint4 Asako Takanohashi,

Kristy J. Brown, Adeline Vanderver, Brian Halligan,

and Yetrib Hathout

Index

前言/序言


好的,這裏為您提供一本名為《細胞信號轉導:基礎與前沿》的圖書簡介,內容將詳細描述該書的核心主題、結構和潛在讀者群體,同時避免提及您提供的“新生物學叢書:比較蛋白質組學的生物信息學(影印版)”的任何內容。 --- 圖書名稱:《細胞信號轉導:基礎與前沿》 圖書簡介 一、 概述:生命活動的精密調控 《細胞信號轉導:基礎與前沿》是一部全麵深入探討生命體細胞如何感知、處理和響應外界及內部環境變化的權威性著作。細胞信號轉導是現代生命科學研究的核心領域之一,它構成瞭生命活動得以精確、有序執行的底層邏輯。本書旨在係統梳理信號轉導通路的基本原理、關鍵分子機製,並追蹤該領域最前沿的研究進展和應用潛力。 本書突破瞭傳統教科書對單一信號通路的孤立講解模式,強調信號網絡的復雜性、動態性以及跨通路交叉互作的整體視角。通過整閤分子生物學、細胞生物學、生物化學以及係統生物學的最新見解,本書為讀者提供瞭一幅高清的細胞通訊藍圖。 二、 核心內容與結構 本書內容結構嚴謹,邏輯清晰,共分為六大核心部分,覆蓋瞭從基礎概念到尖端技術的完整知識體係。 第一部分:信號轉導基礎理論與分子元件 本部分奠定瞭信號轉導的理論基石。首先介紹瞭信號的産生、信號分子(激素、生長因子、細胞因子等)的分類及其受體結閤的分子動力學。重點解析瞭膜上受體(如GPCRs、受體酪氨酸激酶RTKs、離子通道相關受體)的結構、活化機製及其跨膜信號的初級傳遞過程。此外,還詳細闡述瞭胞內第二信使係統(cAMP, $ ext{IP}_3/ ext{DAG}$, $ ext{Ca}^{2+}$等)在放大和分發信號中的關鍵作用,並對信號轉導中的磷酸化/去磷酸化級聯反應進行瞭係統的化學和結構解析。 第二部分:主要信號通路詳解 這是本書內容最為詳盡的部分,係統剖析瞭當前研究熱點和經典的核心信號通路: 1. MAPK通路傢族: 深入探討瞭ERK、JNK和p38等通路在細胞增殖、分化和應激反應中的特異性調控機製,包括其上遊的Ras/Raf的精確激活過程。 2. $ ext{PI3K}/ ext{Akt}/ ext{mTOR}$通路: 詳細分析瞭這一在細胞生長、代謝和凋亡中占據中心地位的通路,特彆是其在營養感應和癌癥發生中的樞紐作用。 3. $ ext{JAK}/ ext{STAT}$通路: 聚焦於細胞因子和免疫應答中STAT傢族轉錄因子的激活、核易位及基因錶達調控。 4. $ ext{NF-}kappa ext{B}$信號網絡: 闡述瞭其在炎癥、免疫和細胞存活中的關鍵調控環路,包括其復雜的激活和抑製機製。 5. $ ext{Wnt}$與$ ext{Hedgehog}$信號: 探討瞭這兩條在胚胎發育和組織再生中至關重要的信號通路,及其在軸嚮模式形成中的精確時空控製。 第三部分:信號網絡的整閤與調控 本部分關注信號轉導的復雜性——“網絡”而非“綫性通路”。內容涵蓋: 信號的串擾與交叉互作: 分析不同通路如何相互影響,形成復雜的反饋和前饋調控迴路。 時空特異性: 探討細胞如何利用信號分子的擴散梯度、受體內吞和信號蛋白的亞細胞定位來精確控製信號的傳遞時間和地點。 信號的“記憶”與適應性: 討論細胞如何通過錶觀遺傳修飾或蛋白穩定性的變化對持續或重復的信號做齣不同反應。 第四部分:信號轉導與細胞命運決定 本部分將信號通路與具體的細胞生物學結果掛鈎,重點討論信號轉導在以下過程中的核心作用: 細胞周期調控與增殖: 細胞周期檢查點與關鍵信號通路(如$ ext{Rb}$通路)的聯動。 細胞凋亡(程序性細胞死亡): 詳細解析內在和外在凋亡通路(如$ ext{Caspase}$激活)的信號級聯。 細胞遷移與粘附: 信號通路如何重塑細胞骨架,指導細胞的定嚮移動。 乾細胞命運決定: 闡述維持乾細胞特性和誘導其分化所需的關鍵信號環境。 第五部分:信號轉導的前沿研究技術 為瞭跟上領域發展,本書專門闢齣章節介紹用於研究信號轉導的先進技術手段: 活細胞成像技術: FRET、BRET、光遺傳學(Optogenetics)在實時監測信號分子相互作用和蛋白活化狀態中的應用。 高通量篩選技術: 利用CRISPR、siRNA庫篩選信號通路中的新組分。 化學生物學工具: 探針和抑製劑的設計與應用,用於解析特定信號節點的精確功能。 生物信息學與係統生物學建模: 如何利用計算模型來預測信號網絡的動態行為。 第六部分:信號轉導的臨床轉化與應用 本部分聚焦於將基礎知識轉化為治療策略的實踐: 信號通路與疾病: 詳細分析癌癥、神經退行性疾病(如阿爾茨海默病)、糖尿病和自身免疫性疾病中信號轉導的失調機製。 靶嚮治療策略: 介紹目前已上市和正在臨床試驗中的信號通路抑製劑(如激酶抑製劑)的作用原理和麵臨的耐藥性挑戰。 新興療法: 探討基於信號通路調控的新型免疫療法和基因治療策略。 三、 目標讀者 本書內容深度與廣度兼備,特彆適閤以下群體: 1. 生命科學、生物醫學、藥學等相關專業的高年級本科生及研究生: 可作為係統學習信號轉導模塊的專業教材或參考書。 2. 科研工作者與實驗室技術人員: 為從事細胞生物學、免疫學、腫瘤生物學和神經科學研究的人員提供深入的理論背景和技術參考。 3. 製藥及生物技術行業的專業人士: 幫助理解藥物作用靶點和開發新療法的分子基礎。 通過對《細胞信號轉導:基礎與前沿》的學習,讀者將不僅掌握信號轉導的經典知識,更能理解當前生命科學研究的前沿方嚮,為未來的研究和創新打下堅實的基礎。

用戶評價

評分

這本書的裝幀和紙張質量相當不錯,拿在手裏很有分量感,我特彆喜歡這種略帶磨砂質感的封麵,不容易沾染指紋,而且印刷字體清晰,排版也很規整,即使長時間閱讀也不會覺得疲勞。書頁的裁剪邊緣處理得也很到位,沒有毛糙感,整體給人一種專業、嚴謹的感覺。當然,作為一本影印版,它在一些細節上可能不如最新的精裝圖書那樣完美,比如個彆頁麵的墨跡深淺略有差異,或者封麵上的字體壓印深度不一,但這絲毫不會影響核心內容的閱讀體驗,反而增添瞭一種復古的學術氣息。我個人比較看重圖書的物理觸感和視覺呈現,這本書在這方麵確實做得很好,讓我覺得物超所值。而且,作為一個經常需要攜帶書籍齣行的人,它的尺寸也很適中,不會顯得過於笨重,可以輕鬆放入我的背包中。總體來說,這是一本外觀和觸感都令人滿意的圖書,讓人在翻閱時就能感受到作者和齣版方對學術研究的尊重。

評分

這本書的內容更新速度確實令人贊嘆。考慮到生物信息學技術日新月異的發展,我一直擔心自己閱讀的書籍會很快過時。然而,這本書在介紹核心概念的同時,也緊跟瞭最新的技術進展和研究趨勢。它不僅涵蓋瞭比較蛋白質組學的經典分析方法,還引入瞭一些新興的算法和工具,讓我能夠瞭解到當前該領域最前沿的研究動態。書中對於不同算法的比較和權衡分析,也為我選擇閤適的工具提供瞭寶貴的參考。我發現,書中提到的很多方法論,都是我最近在閱讀最新文獻時經常遇到的。因此,這本書就像一個及時的“知識更新器”,讓我能夠更好地理解和消化最新的學術成果。這對於需要不斷追蹤前沿信息的研究者來說,是至關重要的。

評分

這本書最大的亮點在於它將理論知識與實踐應用巧妙地融閤在一起。它不僅僅是枯燥的理論堆砌,而是通過大量的實例和案例研究,生動地展示瞭生物信息學在比較蛋白質組學研究中的實際操作。我尤其喜歡書中對不同研究問題的分析思路和解決方案的呈現,這讓我能夠看到,生物信息學是如何真正地服務於解決生物學難題的。通過這些案例,我不僅學習到瞭具體的分析技術,更重要的是,我學會瞭如何將這些技術應用到自己的研究項目中。書中提供的多種分析策略和評估標準,也幫助我更好地設計實驗和解釋結果。這本書記住瞭我研究生涯中的“盲點”,為我打開瞭新的思路。我發現,在閱讀這本書的過程中,我自身的科研能力也在潛移默化中得到瞭提升。

評分

我是一名初入蛋白質組學研究領域的研究生,最初對“生物信息學”這個詞感到有些畏懼,認為它門檻很高。但是,當我翻開這本書後,我的疑慮被打消瞭。作者的寫作風格非常循序漸進,從最基礎的概念講起,逐步引入更復雜的分析技術。語言錶達清晰易懂,即使是那些我之前從未接觸過的術語,也能在上下文的幫助下逐漸理解。書中還提供瞭很多實用的代碼示例和操作指南,這對於我這樣的初學者來說,簡直是無價之寶。我嘗試著跟著書中的步驟進行瞭一些簡單的分析,發現操作起來並沒有想象中那麼睏難。這本書讓我對生物信息學在比較蛋白質組學中的應用有瞭全新的認識,並且培養瞭我獨立進行數據分析的信心。我非常感激作者能夠用如此友好的方式,將如此專業的技術呈現齣來,讓我能夠順利地踏上這條學術之路。

評分

這本書的內容深度和廣度都超乎我的預期,它不僅僅是對某一特定領域的淺嘗輒止,而是將比較蛋白質組學這個復雜的主題,通過生物信息學的視角進行瞭係統性的梳理和深入的探討。我尤其欣賞其中關於數據處理和分析部分的講解,作者並沒有簡單地羅列算法和工具,而是詳細闡述瞭每一種方法的原理、適用場景以及潛在的局限性。這對於我們這些非生物信息學專業齣身,但又希望在這個領域有所突破的研究者來說,無疑是雪中送炭。書中穿插的案例分析也非常有說服力,讓我能夠更直觀地理解抽象的理論概念,並將其與實際研究問題聯係起來。雖然某些章節的難度係數不低,需要反復咀嚼,但正是這種深入的講解,纔真正體現瞭這本書的價值。我發現很多在文獻中難以找到的細節,在這本書裏得到瞭清晰的解答,這極大地節省瞭我查閱大量資料的時間和精力。

評分

京東速度不錯,書也還行。

評分

Bioinformatics for Comparative Proteomics影印版,英文書,印刷還是很清楚的,這本書的內容一共包括三個部分,第一部分是主要內容是比較蛋白質組學生物信息學的基本框架,包括蛋白質數據庫的資源,指南,蛋白質分類等,第二部分主要講述瞭蛋白質組學的一些數據分析的算法,第三部分主要講述瞭比較蛋白組學,內容還是不錯的。

評分

英文的,專業性強,內容很係統。

評分

英文的,專業性強,內容很係統。

評分

印刷質量還可以,送貨到傢很方便

評分

包裝呀唉

評分

挺好的,質量不錯,便宜,速度快

評分

印刷質量還可以,送貨到傢很方便

評分

Bioinformatics for Comparative Proteomics影印版,英文書,印刷還是很清楚的,這本書的內容一共包括三個部分,第一部分是主要內容是比較蛋白質組學生物信息學的基本框架,包括蛋白質數據庫的資源,指南,蛋白質分類等,第二部分主要講述瞭蛋白質組學的一些數據分析的算法,第三部分主要講述瞭比較蛋白組學,內容還是不錯的。

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