內容簡介
《分子生態學與數據分析基礎》首先從理論上介紹瞭分子生態學基本研究內容和手段,並總結作者以往的研究工作,較全麵地概括瞭分子生態學理論內涵;然後從實踐角度介紹瞭分子生態學數據獲得的方法與具體分析內容和步驟,特彆是采用圖解法一步一步對分子生態學用到的各種主流分析軟件進行過程講解(包括作者編寫的程序),不但有各類分析提示,還提供演示數據。《分子生態學與數據分析基礎》具有極強的理論性和實踐操作性,對於促進我國分子生態學發展,利用分子遺傳標記手段進行物種經營、保護及資源利用和環境規劃具有重要的推動作用。
《分子生態學與數據分析基礎》可供高等學校、研究機構從事分子生態學和相關領域研究的師生,以及農、林、牧、副、漁、醫各行業利用分子遺傳標記開展研究的工作人員閱讀參考。
內頁插圖
目錄
前言
第一部分 分子生態學理論
第一章 分子生態與遺傳變異
第一節 遺傳變異的産生
第二節 分子標記的種類
第三節 遺傳變異的衡量
第四節 遺傳變異的維持、喪失
第二章 分子生態學研究內容
第一節 個體與物種區分、鑒定(差異與多樣性)
第二節 基因流和適應
第三節 小種群
第二部分 分子生態數據獲得與分析——以微衛星體分子標記為例
第三章 分子遺傳標記的獲得——微衛星體
第一節 微衛星體獲得:MsatCommander、inGAP、MicrotFamily和GelQuest軟件
第二節 微衛星體數據初步整理分析:GenAlEx軟件及其遺傳多樣性大小衡量
第四章 遺傳變異狀況
第一節 Hardy-Weinberg平衡檢測:Genepop、SGoF+軟件
第二節 連鎖不平衡檢測:Genepop軟件
第三節 等位基因豐富度比較:ADZE軟件
第五章 遺傳分化
第一節 FST分析:Genetix軟件
第二節 AMOVA分析:GenAIEx軟件
第六章 分組分析
第一節 Structure軟件分析及CONVERT、Structure Harvester、CLUMPP軟件
第二節 TESS軟件分析及PAST、TESS Ad-Mixer軟件
第七章 空間遺傳結構分析
第一節 sPCA分析
第二節 Alleles in space和Surfer軟件
第三節 空間自相關分析:SPAGeDi軟件
第四節 空間遺傳結構的異嚮性:PASSAGE軟件和R程序
第八章 景觀遺傳學分析
第一節 錶麵距離:ArcGIS軟件
第二節 加權綫性距離、最小成本距離和阻抗距離:R程序
第三節 Mantel test和Partial Mantel test:PASSaGE軟件
參考文獻
前言/序言
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